IMC技术再现风湿学领域top级期刊 | 成纤维细胞亚群或将成为系统性硬化症治疗靶标

统性硬化症（SSc）是一种纤维化疾病，主要影响皮肤和内脏器官。成纤维细胞是纤维化组织重塑的关键效应细胞，但对其异质性、表型、局部微环境和细胞间相互作用的理解有限。

2024-10-31

Cancer Cell：空间蛋白组IMC发现免疫疗法介导的实体瘤消除需要瘤内免疫三联体

近期，美国纪念斯隆凯特林癌症研究所Andrea Schietinger等研究人员合作发现，免疫疗法介导的实体瘤消除需要瘤内免疫三联体。研究结果“Intratumoral immune triads are required for immunotheapy-mediated elimination of solid tumors"发表在期刊《Cancer Cell》上，研究人员证明肿瘤反应性CD4+和CD8+T细胞与抗原呈递细胞（APC）一起形成“三联体”时，CD4+T细胞在实体瘤内介导肿瘤特异性CD8+T细胞重编程，逆转其功能障碍。此外，在接受免疫检查点阻断（ICB）治疗的胸膜间皮瘤患者中，三联体与临床反应相关。这些发现提示CD4+T细胞-CD8+T细胞-APC三联体的形成是提升ACT和ICB对实体瘤功效的关键因素。

2024-07-11

Cancer Cell封面文章 | 空间多组学分析揭示了原位和侵袭性肢端型黑色素瘤的克隆演化规律及肿瘤-免疫的相互作用机制

在肢端黑色素瘤(AM)中，从原位(AMis)进展到侵袭性AM (iAM)导致生存率显著降低。但目前AMis向iAM的演化过程尚不清楚，免疫微环境在这一过程中发挥的作用也不明确。

2024-06-06

Cancer Cell：CODEX+scRNA-seq揭秘三阴乳腺癌ICB联合放疗响应轨迹

在早期三阴乳腺癌（TNBC）中，使用PD-1阻滞抗体（帕博利珠单抗，pembro）联合化疗可以改善无事件生存率。有趣的是，ICI对无事件生存的益处在PD-L1阳性和阴性队列中都存在，这表明单独的PD-L1并不能预测反应，需要更深入了解肿瘤免疫微环境（TME）如何决定反应，以找到更好的预测标志物并开发定制联合疗法。

近日，Cancer Cell杂志上发表了题为“Single-cell and spatial profiling identify three response trajectories to pembrolizumab and radiation therapy in triple negative breast cancer”的研究论文，该研究通过CODEX和scRNA-seq技术分析了anti-PD-1治疗并额外接受RT治疗的TNBC患者的免疫细胞与非免疫细胞在空间上的浸润以及共定位情况。

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2024-05-28

Cancer Discovery | IMC构建肺癌单细胞空间图谱揭示肿瘤微环境与癌症转移的关系

由于肿瘤微环境（TME）的构成在整个肿瘤和肿瘤周围都会发生变化，因此观察肿瘤的多个部位及其周围环境有助于更准确地了解疾病进展过程中发生的情况。

近期，伦敦大学洛杉矶分校（UCL）和弗朗西斯-克里克研究所（Francis Crick Institute）的研究团队使用先进的空间蛋白成像技术IMC，通过调查参与TRACERx研究的81名非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤和正常组织样本，绘制了单细胞空间图谱，并勾勒出了肺癌中的四种不同微环境，并揭示了髓系细胞和T细胞的空间结构与免疫逃逸和临床结局的关系。

2024-05-09

【Cell】空转Visium与CODEX的强强联合发现胶质母细胞瘤具有多层结构

早先的研究通过scRNA-seq分析了GBM内的不同细胞成分，定义了三种主要的恶性细胞状态，以及不同GBM亚型的GBM免疫细胞的情况。但缺乏在GBM生态系统中对这些已定义的细胞成分进行原位空间映射。

2024-04-29

Cancer Discovery | 空间蛋白组揭秘肿瘤相关巨噬细胞的生态位与结肠癌预后的关系

肿瘤相关巨噬细胞具有转录异质性，其形成巨噬细胞组织作用的空间分布和细胞相互作用仍缺乏研究。

近期，美国斯坦福大学的Matt van de Rijn教授团队通过scRNA-seq数据和空间蛋白组CODEX、mIHC、DSP技术解析了人正常和恶性乳腺和结肠组织中的空间巨噬细胞群，并揭示了它们之间的关联。共定义了五种巨噬细胞群，发现它们并不是随机分布的，而是占据了空间上不同的生态位，并对患者的预后产生了不同的影响。其中IL4I1+巨噬细胞在高细胞周转率区域内吞噬死亡细胞，预示着结肠癌的良好预后；相反，SPP1+巨噬细胞富集于缺氧和坏死的肿瘤区域，预示着结肠癌的不良预后。

2024-04-25

Nature | IMC 揭秘肺癌免疫微环境的单细胞空间景观

单细胞技术以其精准的分辨率揭示了肿瘤免疫微环境的复杂性。大多数临床诊疗依赖于肿瘤亚型的组织病理学分层，但对这些分层的亚组中单细胞表型的空间图谱了解甚少。

近期，加拿大麦吉尔大学古德曼癌症研究所的Logan Walsh团队在《Nature》上发表了名为“Single-cell spatial landscapes of the lung tumour immune microenvironment”的研究。

该研究通过成像质谱流式技术（IMC）表征了416例非小细胞肺癌样本的免疫微环境特征，深入解析了160万个细胞，分析了细胞免疫谱系和激活状态与患者临床结局的相关性。

2023-05-03

Nature Communications | 翻翻scRNA-seq数据集，添点 IMC数据分析，给您不一样的高分体验！

肿瘤相关成纤维细胞(CAF)是肿瘤微环境中的一种多样化的细胞群，对肿瘤的演变和患者的预后有重要影响。
为了定义CAF表型，研究人员分析了来自14名乳腺癌患者肿瘤的16,000多个间质细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集，在此基础上定义并在功能上注释了9种CAF表型和一类周细胞。研究人员在另外四种癌症类型中验证了这种分类系统，并在匹配的乳腺癌样本上使用组织成像质谱流式（IMC）技术来确认在蛋白质水平上定义的CAF表型，并分析它们在肿瘤中的空间分布。这种CAF分类方案将允许比较不同研究中的CAF表型，促进对其功能作用的分析，并有可能指导未来新治疗策略的开发。

2023-11-30

IF=24.3：scRNA-seq & mIHC发现胃癌耐药性机制

抗PD1+化疗是胃癌（GC）综合治疗中不可或缺的一部分。在进展期胃癌患者中，使用新辅助免疫治疗加化疗可以引起持续的反应，但大多数患者表现出原发耐药性，并且部分确实有反应的患者经常随着时间的推移而产生获得性耐药性。迫切需要在这种背景下研究耐药的细胞和分子基础。

2024-04-10

临床试验项目 | CODEX揭示天疱疮慢性水疱中TLSs微环境生态

天疱疮是一种罕见的危及生命的自身免疫性疾病，表现为皮肤和/或粘膜上的水泡和侵蚀。尽管已在天疱疮患者的炎性病变中检测到三级淋巴结构（TLSs ），但TLSs在天疱疮发病机制中的作用仍不清楚。

近期，来自韩国延世大学医学院的研究人员在《Journal of Clinical Investigation》期刊（IF=15.9）上发表题为“Microenvironmental network of clonal CXCL13+CD4+ T cells and regulatory T cells in pemphigus chronic blisters”的研究文章，揭示天疱疮患者慢性水疱中存在含有桥粒芯蛋白（DSG）特异性B细胞和浆细胞的TLSs，且CXCL13表达上调。

2023-12-14